1. Instituto Nacional de Pediatría
2. INP
3. Artículos

Título :	High-Throughput Profiling of Caenorhabditis elegans Starvation-Responsive microRNAs.
Creador:	Garcia Segura, Laura
Nivel de acceso:	Open access
Palabras clave :	Animales Caenorhabditis elegans - genética Expresión Génica Perfilación de la Expresión Génica Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento MicroARNs Transducción de Señales - genética Inanición - genética Animals Caenorhabditis elegans - genetics Gene Expression Gene Expression Profiling High-Throughput Nucleotide Sequencing MicroRNAs Signal Transduction - genetics Starvation - genetics MicroARNs Caenorhabditis elegans Inanición genética Perfilación de Transcriptomas MicroRNAs Caenorhabditis elegans Starvation genetics Gene Expression Profiling
Descripción :	Los microARNs (miRNAs) son ARN no codificantes de ~ 22 nucleótidos de longitud que regulan la expresión génica interfiriendo con la estabilidad y traducción de los ARNm. Su expresión se regula durante el desarrollo, en una amplia variedad de condiciones de estrés y en varios procesos patológicos. En la naturaleza, los animales suelen enfrentarse a condiciones de fiesta o de hambre. Se observó que al someter larvas tempranas de L4 de Caenorhabditis elegans a un período de hambre de 12 horas produjo gusanos que son más delgados y más cortos que los animales bien alimentados, con una disminución de la acumulación de lípidos, disminución de la progenie, reducción del tamaño de las gónadas y aumento de la esperanza de vida. Nuestro objetivo fue identificar cuál de los 302 miARN conocidos de C. elegans cambió su expresión en condiciones de inanición en comparación con los gusanos bien alimentados mediante secuenciación profunda en larvas tempranas de L4. Nuestros resultados indican que 13 miRNAs (miR-34-3p, la familia de miR-35-3p a miR-41-3p, miR-39-5p, miR-41-5p, miR-240-5p, miR-246- 3p y miR-4813-5p) fueron upregulated, mientras que 2 miRNAs (let-7-3p y miR-85-5p) fueron downregulated en 12 hr hambre vs bien alimentado temprano L4 larvas. Algunos de los objetivos predichos de los miRNAs que cambiaron su expresión en condiciones de hambre están involucrados en procesos metabólicos o de desarrollo. En particular, miARNs de la familia de miR-35 fueron upregulated 6-20 veces en la inanición. Además, se mostró que la expresión de gld-1, importante en oogenesis, un objetivo validado de miR-35-3p, downregulated cuando la expresión de miR-35-3p se upregulated. La expresión de otro objetivo informado, el regulador del ciclo celular lin-23, permaneció sin cambios durante la inanición. Este estudio representa un punto de partida para una comprensión más completa del papel de los miRNAs durante el hambre en C. elegans MicroRNAs (miRNAs) are non-coding RNAs of ~22 nucleotides in length that regulate gene expression by interfering with the stability and translation of mRNAs. Their expression is regulated during development, under a wide variety of stress conditions and in several pathological processes. In nature, animals often face feast or famine conditions. We observed that subjecting early L4 larvae from Caenorhabditis elegans to a 12-hr starvation period produced worms that are thinner and shorter than well-fed animals, with a decreased lipid accumulation, diminished progeny, reduced gonad size, and an increased lifespan. Our objective was to identify which of the 302 known miRNAs of C. elegans changed their expression under starvation conditions as compared to well-fed worms by means of deep sequencing in early L4 larvae. Our results indicate that 13 miRNAs (miR-34-3p, the family of miR-35-3p to miR-41-3p, miR-39-5p, miR-41-5p, miR-240-5p, miR-246-3p and miR-4813-5p) were upregulated, while 2 miRNAs (let-7-3p and miR-85-5p) were downregulated in 12-hr starved vs. well-fed early L4 larvae. Some of the predicted targets of the miRNAs that changed their expression in starvation conditions are involved in metabolic or developmental process. In particular, miRNAs of the miR-35 family were upregulated 6-20 fold upon starvation. Additionally, we showed that the expression of gld-1, important in oogenesis, a validated target of miR-35-3p, was downregulated when the expression of miR-35-3p was upregulated. The expression of another reported target, the cell cycle regulator lin-23, was unchanged during starvation. This study represents a starting point for a more comprehensive understanding of the role of miRNAs during starvation in C. elegans.
Colaborador(es) u otros Autores:	Abreu-Goodger C3 Hernandez-Mendoza A4 Dimitrova Dinkova TD5 Padilla-Noriega L6 Perez-Andrade ME2 Miranda-Rios J
Fecha de publicación :	2015
Tipo de publicación:	Artículo
Identificador del Recurso :	10.1371/journal.pone.0142262
Fuente:	Plos One 10(11):1-22
URI :	http://repositorio.pediatria.gob.mx:8180/handle/20.500.12103/2482
Idioma:	eng
Aparece en las colecciones:	Artículos

Los ítems de DSpace están protegidos por copyright, con todos los derechos reservados, a menos que se indique lo contrario.