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Título :	Helicobacter pylori genotyping from american indigenous groups shows novel amerindian vacA and cagA alleles and Asian, African and European admixture
Creador:	Camorlinga Ponce, Margarita
Nivel de acceso:	Open access
Descripción :	Es valioso para ampliar estudios de genotipificación de Helicobacter pylori a cepas de comunidades indígenas en todo el mundo a definir mejor adaptación, evolución y enfermedades asociadas. El objetivo fue caracterizar genéticamente ambos individuos humanos y su infección H. pylori de las comunidades indígenas de México y compararlos con los de otros humanos grupos. Se estudiaron individuos de tres grupos indígenas Tarahumaras del norte, Huicholes del oeste y Nahuas del centro de la ciudad de México. Voluntarios fueron muestreados en su sitio de la comunidad, el ADN fue aislado de blancos de la sangre las células, y-cromosoma y mtDNA y STR se estudiaron alelos. H. pylori fue cultivado de jugo gástrico, y ADN extraído para el Genotipado de los genes housekeeping y virulencia. Se encontraron haplogrupos de ADNmt amerindio (A, B, C y D), Ychromosome DYS19T y los alelos STRs amerindios frecuentes en los tres grupos, confirmación de ascendencia amerindia en estos Grupos mexicanos. Sobre h. pylori cagA análisis phylogenetic, aunque más aislados fueron del tipo occidental, un nuevo Grupo amerindio ni occidental ni asiático, estaba formado por algunos indígenas mexicanos, colombiano, peruano y Aislamientos de Venezuela. Del mismo modo, los análisis filogenéticos vacA mostraron la existencia de una novela tipo amerindio en aislamientos de Alaska, México y Colombia. Con hspA cepas procedentes de México y otros grupos americanos agrupan dentro de los tres principales grupos, asiáticos, africanos o europeos. Genotipificación de los genes housekeeping confirmaron que las cepas mexicanas formaron una novela Grupo amerindio relacionado con el asiático junto con cepas de remotos aborígenes del Amazonas. Este estudio muestra que México indígenas con marcadores amerindios están colonizadas con H. pylori que muestra la adición del asiático, Europea y africana cepas en genes conocidos para interactuar con la mucosa gástrica. Presentamos la evidencia de nuevos alelos amerindios de cagA y vacA en los grupos indígenas de América del norte y del sur. It is valuable to extend genotyping studies of Helicobacter pylori to strains from indigenous communities across the world to better define adaption, evolution, and associated diseases. We aimed to genetically characterize both human individuals and their infecting H. pylori from indigenous communities of Mexico, and to compare them with those from other human groups. We studied individuals from three indigenous groups, Tarahumaras from the North, Huichols from the West and Nahuas from the center of Mexico. Volunteers were sampled at their community site, DNA was isolated from white blood cells and mtDNA, Y-chromosome, and STR alleles were studied. H. pylori was cultured from gastric juice, and DNA extracted for genotyping of virulence and housekeeping genes. We found Amerindian mtDNA haplogroups (A, B, C, and D), Y-chromosome DYS19T, and Amerindian STRs alleles frequent in the three groups, confirming Amerindian ancestry in these Mexican groups. Concerning H.pylori cagA phylogenetic analyses, although most isolates were of the Western type, a new Amerindian cluster neither Western nor Asian, was formed by some indigenous Mexican, Colombian, Peruvian and Venezuelan isolates. Similarly, vacA phylogenetic analyses showed the existence of a novel Amerindian type in isolates from Alaska, Mexico and Colombia. With hspA strains from Mexico and other American groups clustered within the three major groups, Asian, African or European. Genotyping of housekeeping genes confirmed that Mexican strains formed a novel Asian-related Amerindian group together with strains from remote Amazon Aborigines. This study shows that Mexican indigenous people with Amerindian markers are colonized with H. pylori showing admixture of Asian, European and African strains in genes known to interact with the gastric mucosa. We present evidence of novel Amerindian cagA and vacA alleles in indigenous groups of North and South America. © 2011 Camorlinga-Ponce et al.
Colaborador(es) u otros Autores:	Perez Perez Guillermo Gonzalez Valencia Gerardo Mendoza Irma Peñaloza Espinosa Rosenda Ramos Irma Kersulyte Dangeruta Reyes León Adriana Romo Carolina Granados Julio Muñóz Leopoldo Berg Douglas E Torres Javier
Fecha de publicación :	2011
Tipo de publicación:	Artículo
Formato:	pdf
Identificador del Recurso :	10.1371/journal.pone.0027212
Fuente:	Plos One 6(11):e27212
URI :	http://repositorio.pediatria.gob.mx:8180/handle/20.500.12103/2471
Idioma:	eng
Aparece en las colecciones:	Artículos

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